Ein Update auf Joomla 1.5 sollte da sicherlich helfen, da das ja eine komplett eigenständige Installation ist, bei der keine FTP-Daten übernommen werden, d.h. es wird auch kein Schadcode übernommen.
Was übernommen wird, sind die User, die Menüstruktur und die in Joomla verfassten Beiträge, aber nicht das Template und 3rd-Party-Komponenten wie Foren, Fotogalerien etc.
Zugangsdaten gehen nochmal per Mail raus.