Im Root-Ordner geht das nicht. Die Struktur auf der Ebene von /html als Root ist festgelegt. Das Erstellen neuer Ordner geht erst unterhalb von /html, also zum Beispiel wäre folgende Kombination möglich:
/html/installation2 oder ähnliches. Dieser Ordner hat dann mit der ersten Installation auch nichts zu tun.
Oder Sie erstellen zwei Ordner, /html/mambo1 und /html/mambo2, in den ersten Ordner verschieben Sie die aktuelle Installation und passen die Pfade in der configuration.php an, und in den zweiten Ordner installieren Sie das nächste Mambo, bzw. laden dort Ihre anderen Daten hoch.