Ich hatte ein ähnliches Problem, allerdings mit auf unpublished gesetztem Content, den ich per mirgrator-Script aus einer alten Installation übernommen hatte. Dort hat letztendlich nur geholfen, die betreffenden Artikel direkt in der Datenbank zu löschen, nachdem ich die Beiträge in Joomla bereits gelöscht hatte.
Vielleicht ist das ja ein ähnliches Problem.
Gruß Malte